Ekoloji siyasət şöbəsi

Ekoloji təhlükəsizlik fəaliyyətinin təhlili və qiymətləndirilməsi şöbəsi

Beynəlxalq əməkdaşlıq şöbəsi

Ekoloji maarifləndirmə və kommunikasiya şöbəsi

Ətraf mühitin və təbii sərvətlərin idarə edilməsi şöbəsi

Texniki təminat şöbəsi

Hüquq və insan resursları şöbəsi

Maliyyə və iqtisadiyyat şöbəsi

Sənədlərlə və vətəndaşların müraciətləri ilə iş şöbəsi